MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium callunae DSM 20147 plasmid pCC1

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020523	GCA	2	6	398	403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157220
2	NC_020523	CAC	2	6	437	442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
3	NC_020523	ACC	2	6	447	452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
4	NC_020523	AAC	2	6	488	493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470157220
5	NC_020523	GCAC	2	8	579	586	25 %	0 %	25 %	50 %	470157220
6	NC_020523	GCTG	2	8	632	639	0 %	25 %	50 %	25 %	470157220
7	NC_020523	TAA	2	6	692	697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470157220
8	NC_020523	CCG	2	6	757	762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157220
9	NC_020523	CGT	2	6	777	782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157220
10	NC_020523	ACC	2	6	795	800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
11	NC_020523	GAA	2	6	947	952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470157220
12	NC_020523	GTG	2	6	977	982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470157220
13	NC_020523	CCA	2	6	1066	1071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
14	NC_020523	CGCTA	2	10	1107	1116	20 %	20 %	20 %	40 %	470157220
15	NC_020523	TGA	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470157220
16	NC_020523	CAT	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157220
17	NC_020523	GCA	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157220
18	NC_020523	GC	3	6	1336	1341	0 %	0 %	50 %	50 %	470157220
19	NC_020523	CCA	2	6	1393	1398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157220
20	NC_020523	AAAC	2	8	1410	1417	75 %	0 %	0 %	25 %	470157220
21	NC_020523	A	6	6	1437	1442	100 %	0 %	0 %	0 %	470157220
22	NC_020523	TG	3	6	1561	1566	0 %	50 %	50 %	0 %	470157220
23	NC_020523	CCGG	2	8	1705	1712	0 %	0 %	50 %	50 %	470157220
24	NC_020523	TCAC	2	8	2306	2313	25 %	25 %	0 %	50 %	470157221
25	NC_020523	CAC	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157221
26	NC_020523	GCGG	2	8	2392	2399	0 %	0 %	75 %	25 %	470157221
27	NC_020523	CAT	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157221
28	NC_020523	CGAG	2	8	2463	2470	25 %	0 %	50 %	25 %	470157221
29	NC_020523	ACC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157221
30	NC_020523	CGA	2	6	2578	2583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157222
31	NC_020523	CAC	4	12	2629	2640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157222
32	NC_020523	AGCA	2	8	2658	2665	50 %	0 %	25 %	25 %	470157222
33	NC_020523	TGC	2	6	2782	2787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157222
34	NC_020523	AGCG	2	8	2799	2806	25 %	0 %	50 %	25 %	470157222
35	NC_020523	AGG	2	6	2847	2852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470157222
36	NC_020523	GCTACC	2	12	2879	2890	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470157222
37	NC_020523	AGC	2	6	2907	2912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470157222
38	NC_020523	TGGAC	2	10	2919	2928	20 %	20 %	40 %	20 %	470157222
39	NC_020523	TGC	2	6	3049	3054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157222
40	NC_020523	TGAG	2	8	3130	3137	25 %	25 %	50 %	0 %	470157222
41	NC_020523	CCG	2	6	3163	3168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470157223
42	NC_020523	CAC	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470157223
43	NC_020523	T	6	6	3351	3356	0 %	100 %	0 %	0 %	470157223
44	NC_020523	CTA	2	6	3364	3369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157223
45	NC_020523	TAC	2	6	3439	3444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157223
46	NC_020523	A	6	6	3477	3482	100 %	0 %	0 %	0 %	470157223
47	NC_020523	ACCA	2	8	3485	3492	50 %	0 %	0 %	50 %	470157223
48	NC_020523	ACTC	2	8	3553	3560	25 %	25 %	0 %	50 %	470157223
49	NC_020523	CGT	2	6	3799	3804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470157224
50	NC_020523	TAC	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470157224
51	NC_020523	TAGC	2	8	3949	3956	25 %	25 %	25 %	25 %	470157224

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.